创圣纪0011年的地球，由于11年前的大异变，人类丧失了2/3的人口。
南极冰山溶化，1万2千年前灭亡的亚特兰蒂亚重现于世，拥有双翼的「堕天翅族」苏醒了。他们将生物机械兵器「神话兽」接连送入人类的都市，捕获人类，摄取生体能源「Purana」。
另一方面，人类决心反击，从海底遗迹发掘岀三台组合（hybrid）战斗机「Vector Machine」。这是1万2千年前，将堕天翅族逼入灭亡绝境的传说中的兵器。Vector Machine经过合体，「机械天使Aquarion」即将现身。
要启动Aquarion，需要能与机体的机械生命感应和共鸣，称为「Element」的人。这要求特别敏锐的五感和纯真的灵魂，因此十五岁左右的少年少女们被选为机师，集中起来。
而后，「机械天使Aquarion」合体的时刻终于到来…
游佐浩二 诹访部顺一 东山奈央 落合弘治 大原沙耶香 羽多野涉 钉宫理惠 中村悠一 谷山纪章 平野绫 白石凉子 户松遥 野上尤加奈 楠大典 森巧治 小松史法 坪井智浩 里卓哉 小山刚志 金光宣明 箭内仁 峰畅也
竹达彩奈 阿澄佳奈 井口裕香 仪武祐子 茅野爱衣 寿美菜子 东山奈央 内田彩 飯塚麻結 葉月絵理乃 大原沙耶香 福井裕佳梨 宫本佳那子 广桥凉 间岛淳司 古川登志夫 平野文 绿川光 中田让治
铃村健一 森川智之 樱井孝宏 伊藤步 诹访部顺一 藤原启治 楠大典 浪川大辅 丰口惠美 青木麻由子 佐藤银平 大塚芳忠 奥田启人 伊丸冈笃 桐井大介 宝龟克寿 野泽那智 藤冈弘